23.2.5. Нёбные миндалины

Структура и
функциональная роль нёбных миндалин
уже рассматривались нами в п. 21.1.2.3.
Тем
не менее, напомним основные моменты.

23.2.5.1. Структурные элементы

23.2.5.2. Препарат

23.2.6. Зубы

23.2.6.1. Общие сведения

Гистологический анализ состояния небных миндалин при хроническом тонзиллите

Журнал «Медицинский совет» №20, 2019г.

DOI: https://doi.org/10.21518/2079-701X-2019-20-68-71

В.Т. Пальчун,   А.В. Гуров, ORCID: 0000-0001-9811-8397, e-mail: [email protected],  Т.К. Дубовая, ORCID: 0000-0001-7936-180X,  А.Г. Ермолаев, ORCID: 0000-0003-2642-5173, Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова

Статья посвящена проблеме хронического тонзиллита. Целью исследования являлась оценка изменений морфофункционального состояния небных миндалин в условиях хронического воспаления. В исследовании представлены сравнительные данные иммуногистохимического исследования небных миндалин в норме и при хронической тонзиллярной патологии. Использовалась клиническая классификация хронического тонзиллита, разработанная Б.С. Преображенским и В.Т. Пальчуном. В соответствии с этой классификацией описывались гистологические изменения в небных миндалинах при хроническом тонзиллите токсико-аллергической формы II. Контрольную группу составила ткань небных миндалин от пациентов без хронического тонзиллита. Анализ проводился с использованием маркеров апоптоза, антиапоптоза, клеточной пролиферации, а также различных типов лимфоцитов. Описаны методика работы с тканью миндалин, морфофункциональное состояние в каждой исследуемой группе, проведено сравнение исследуемых показателей в двух группах, отражена динамика изменений в небных миндалинах при хроническом тонзиллите. Увеличение показателей апоптотической и антиапоптотической активности в сочетании со снижением показателей клеточной пролиферации, увеличением количества Т-хелперов и В-лимфоцитов говорит о значительном снижении функциональной активности небных миндалин в условиях хронического воспаления. Эти изменения соотнесены с клинической картиной для выработки наиболее оптимальной тактики лечения.

Для цитирования:

Пальчун В.Т., Гуров А.В., Дубовая Т.К., Ермолаев А.Г., Гистологический анализ состояния небных миндалин при хроническом тонзиллите.  Медицинский Совет. 2019;(20):68-71. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2019-20-68-71

Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Influence of vitamin D deficiency on progression of inflammation and reparative healing in patients with orofacial region diseases

Vladimir T. Pal’chun,  Aleksandr V. Gurov, ORCID: 0000-0001-9811-8397, e-mail: [email protected],  Tatyana K. Dubovaya, ORCID: 0000-0001-7936-180X,  Vladimir G. Ermolaev, ORCID: 0000-0003-2642-5173, Pirogov Russian National Research Medical University

The article is devoted to the problem of chronic tonsillitis. The aim of the study was to assess changes in the morphofunctional state of the palatine tonsils in chronic inflammation. The study presents comparative data of immunohistochemical examination of the tonsils in normal and chronic tonsillar pathology. The authors used the clinical classification of chronic tonsillitis developed by B. S. Preobrazhensky and V.T. Pal’chun. Histological changes in the palatine tonsils of patients with toxic-allergic form 2 chronic tonsillitis were described in accordance with this classification. The control group represented palatine tonsils tissue taken from patients without chronic tonsillitis. The examination was carried out using markers of apoptosis, antiapoptosis, cell proliferation, as well as various types of lymphocytes. The authors describe a tonsil tissue handling technique, morphological and functional state in each study group, compared the studied parameters in two groups, reflected the dynamics of changes in the palatine tonsils with chronic tonsillitis. Increased apoptotic and anti-apoptotic activity combined with decreased cell proliferation, increased number of T-helpers and B-lymphocytes gives evidence of significantly decreased functional activity of the palatine tonsils in chronic inflammation. These changes are correlated with the clinical picture to develop the most optimal management of the disease.

For citation:

Pal’chun V.T., Gurov A.V., Dubovaya T.K., Ermolaev A.G. Histological examination of the palatine tonsils in chronic tonsillitis. Medical Council. 2019;(20):68-71. (In Russ.) https://doi.org/10.21518/2079-701X-2019-20-68-71

Conflict of interest: The authors declare no conflict of interest.

Введение

Высокая частота обращений к врачам амбулаторного звена сохраняется на протяжении многих лет, в т. ч. к врачам-оториноларингологам, при этом значительная часть из обращений является повторной. В свою очередь, среди лор-патологии существенную долю занимает патология глотки в целом и небных миндалин в частности. Большой процент повторных обращений вызван хронической тонзиллярной патологией.

Хронический тонзиллит (ХТ) представляет собой хорошо изученную нозологию с выработанными критериями диагностики и алгоритмами лечения. В то же время некоторые вопросы классификации тонзиллярной патологии и подходов к лечению остаются дискуссионными.

В данном исследовании мы использовали классификацию ХТ, разработанную Б.С. Преображенским и В.Т. Пальчуном [1]. Согласно этой классификации выделяют простую форму заболевания, для которой характерны только местные проявления заболевания и рекомендуется консервативная терапия. При токсико-аллергической форме I степени (ТАФ I) с более выраженной патологией, помимо местных признаков, характерных для простой формы, присутствуют общие токсико-аллергические проявления. При данной форме также рекомендуется консервативная терапия, а при отсутствии эффекта — хирургическое лечение. Токсико-аллергическая форма II степени (ТАФ II) характеризуется еще более выраженными симптомами по сравнению с ТАФ I и наличием сопряженных заболеваний (имеющих общую этиологическую основу с β-гемолитическим стрептококком группы А). При данной форме ХТ рекомендовано хирургическое лечение.

Учитывая, что ХТ является очаговой инфекцией, большое значение имеет своевременная диагностика формы заболевания и выбор тактики лечения, что способствует не только повышению качества жизни пациента, но и предупреждению развития метатонзиллярной патологии, а также снижению экономических затрат на лечение, связанных с повторными обращениями к врачу и уменьшением количества дней нетрудоспособности [2].

Существует большое количество способов консервативной терапии ХТ, но наиболее дискуссионным является вопрос необходимости хирургического лечения, а именно того момента, когда стоит уже отказаться от консервативной терапии и выполнить тонзиллэктомию. Для ответа на данный вопрос необходимо углубленное исследование состояния небных миндалин. В связи с этим целью нашей работы является проведение морфофункционального исследования состояния небных миндалин в норме и при хронической тонзиллярной патологии.

В доступной нам литературе имеется большое количество описаний гистологического строения небных миндалин и динамики развития патологических изменений при ХТ. Однако в подавляющем большинстве случаев используются стандартные гистологические методы, дающие лишь общее представление о строении небных миндалин в норме и при хронической тонзиллярной патологии [3, 4].

В настоящее время в гистологических и патолого-анатомических исследованиях используются более информативные методы, в частности иммуногистохимические (ИГХ). В литературе есть данные о применении этих методов при изучении ХТ, и при их получении были использованы одновременно в одном исследовании не более 2-3 маркеров, что не позволяло получить полноценное представление о состоянии объекта исследования [5, 6].

В настоящей работе для оценки морфофункционального состояния небных миндалин было сформировано две исследуемые группы пациентов и, соответственно, получено два блока биоматериала (образцов ткани миндалин) от этих пациентов.

Первую группу, контрольную, составили пациенты, не имеющие клинических признаков ХТ с отрицательным результатом микробиологического исследования в отношении Streptococcus pyogenes. Забор материала для исследования был произведен при проведении тонзиллотомии у пациентов с папилломами небных миндалин (n = 3) и тонзиллэктомии при увулопалатофарингопластике (n = 2). Общее количество в данной группе составило 5 человек (из них двое мужчин и три женщины) в возрастном диапазоне от 27 до 46 лет, средний возраст 37,4 года.

Во вторую группу, экспериментальную, вошли пациенты с клинически диагностированным и лабораторно подтвержденным диагнозом «ХТ ТАФ II». Образцы ткани для исследования были получены при проведении плановых и экстренных тонзиллэктомий. Общее количество пациентов, включенных в данную группу, составило 42 человека (из них 24 мужчины и 18 женщин) в возрастном диапазоне от 18 до 58 лет, средний возраст 35,57 года.

Критериями включения в обе группы исследования, помимо описанных выше, явилось отсутствие у пациентов тяжелых сопутствующих заболеваний, которые прямо или косвенно могли повлиять на результаты исследования (сахарный диабет, ангиопатии, иммунокомпетентные состояния, эндокринные заболевания, онкологические заболевания, туберкулез, гепатиты, ВИЧ).

Образцы ткани небных миндалин, получаемые непосредственно при их удалении, в условиях операционной помещались в 10%-ный раствор нейтрального забуференного формалина для фиксации.

Лабораторный этап исследования. Фиксация материала в растворе формалина в течение 3-5 дней –> дегидратация в растворах спиртов восходящей концентрации –> просветление в ксилоле –> заливка в парафине –> изготовление парафиновых блоков с последующим изготовлением срезов толщиной 3–4 мкм. Срезы помещали на стекла, покрытые адгезивным составом.

Следующим этапом работы было депарафинирование срезов (стекла помещали в термостат при температуре 60 °С на 30 минут, затем двукратно обрабатывали ксилолом по 3 минуты, далее двукратно по 3 минуты выдерживали в 100%-ном растворе спирта, после этого двукратно по 3 минуты помещали в 95%-ный раствор спирта и аккуратно промывали проточной водой). Влажные стекла окрашивали соответствующими ИГХ-красителями. Для анализа полученных срезов использовался светооптический микроскоп. Для количественной и полуколичественной оценки реакций на маркеры использовались соответствующие методы морфометрической оценки. Оценивалась площадь участков, занимаемых мечеными клетками, которая выражалась в баллах от 1 до 5, а также по интенсивности окрашивания от 1 до 3 баллов. Баллы суммировались. Следующим этапом проводили статистическую обработку полученных результатов и их сопоставление с клиническими данными.

При окрашивании использовали моноклональные антитела, которые характеризуются единообразием в разных партиях. Этот метод имеет значительные преимущества по сравнению с использованием поликлональных антител.

В каждом исследовании ставили положительный и отрицательный контроли.

При ИГХ-исследовании проводили оценку биологических характеристик лимфоцитов и их субпопуляций в небных миндалинах, уровень их пролиферативной активности и апоптоза, а также элементов микроокружения (табл.).

Таблица. Используемые моноклональные иммуногистохимические антитела и маркируемые объекты

Результаты исследования

Результаты, полученные в первой группе (контроль). Маркирование на Ki-67 по их локализации в лимфоидных узелках было тождественно в обеих небных миндалинах. Высокую экспрессию в 6-7 баллов при этом отмечали в темных зонах герминативных центров, а умеренную в 4-5 баллов – в светлых и мантийных. При этом лимфоциты в межфолликулярных пространствах были негативными на исследуемый маркер, за исключением единичных, диффузно расположенных клеток.

При проведении реакции на выявление белка Вcl-2 окрашенные клетки регистрировались только в лимфоцитах мантийной зоны лимфоидных фолликулов (2-3 балла) при отсутствии окрашивания в герминативном центре.

Слабую ИГХ-реакцию в 2-3 балла визуализировали на каспазу-3 в герминативном центре и мантийных зонах лимфоидных фолликулов.

Низкую экспрессию CD4 в 2-3 балла отмечали в лимфоцитах герминативного центра лимфоидных фолликулов.

CD19 экспрессировались лимфоцитами мантийной зоны лимфоидных фолликулов в 3-4 балла.

При исследовании с используемыми антителами к CD20 отмечали слабое, в 1-2 балла, окрашивание клеток герминативного центра лимфоидных фолликулов.

Результаты, полученные во второй группе (экспериментальной). Маркирование на Ki-67 в лимфоидных узелках демонстрировало умеренную экспрессию в 3-4 балла в лимфоцитах герминативных центров лимфоидных фолликулов.

Умеренную положительную реакцию на Вcl-2 в 3-4 балла отмечали только в мантийной зоне лимфоидных фолликулов.

Маркирование на выявление каспазы-3 положительно в герминативном центре и мантийных зонах лимфоидных фолликулов в 5-6 баллов.

CD4 экспрессировались главным образом клетками герминативного центра в 6-7 баллов и в меньшей степени лимфоцитами мантийной зоны лимфоидных фолликулов в 4-5 баллов.

CD19 экспрессировались в 3-4 балла лимфоцитами мантийной зоны лимфоидных фолликулов.

При исследовании с использованием антител к CD20 отмечалось выраженное окрашивание в 7-8 баллов светлой зоны герминативного центра лимфоидных фолликулов. Кроме того, высокую экспрессию наблюдали в единичных лимфоцитах многослойного плоского неороговевающего эпителия крипт.

Анализ полученных результатов. Высокие значения индекса пролиферации (Ki-67) лимфоцитов указывают на выраженную митотическую активность (87,0 ± 0,34%, р < 0,01) в образцах ткани миндалин, полученных от пациентов контрольной группы, и снижение данного показателя почти в два раза при ХТ (41,0 ± 0,1%, р < 0,01).

Анализ маркирования на Bcl-2 свидетельствовал о том, что антиапоптотическая активность превалирует в лимфоцитах мантийной зоны лимфоидных фолликулов у пациентов 2-й группы (43,2 ± 0,44%, р < 0,01) по сравнению с группой контроля (21,0 ± 0,1%, р < 0,01).

Показатель фазы терминации запрограммированной гибели клеток (каспаза-3) наиболее интенсивно демонстрировали лимфоциты при ХТ (53,1 ± 0,1%, р < 0,01) в отличие от клеток биоматериала, полученного от пациентов контрольной группы (26,2 ± 0,3%, р < 0,01).

Количество Т-лимфоцитов-хелперов было значительно выше у пациентов с ХТ по сравнению с контролем (62,2 ± 0,3 и 28,1 ± 0,1% соответственно, р < 0,01).

Доля В-лимфоцитов в биоматериале, полученном от пациентов, оказалась в обеих группах практически на одинаковом уровне (вторая группа — 38,4 ± 0,1%; контроль — 42,5 ± 0,2%, р < 0,01).

Количество В-лимфоцитов (лимфобластов), согласно маркированию на CD-20, было повышено у пациентов второй группы (78,0 ± 0,14%, р < 0,01) по сравнению с первой контрольной (44,0 ± 0,21%, р < 0,01). Это указывает на интенсификацию лимфоцитопоэза на территории, занимаемой лимфоидными фолликулами, а также процессов дифференцировки и пролиферации в условиях антигенной стимуляции.

Полученные данные свидетельствует о выраженном изменении цитоархитектоники небных миндалин при ХТ ТАФ II. Значительно снижается иммунокомпетентная и барьерная функции, что приводит к формированию в миндалине очага хронической инфекции.

При сопоставлении данных, полученных путем иммуногистохимического исследования, с клинической картиной заболевания и соответствующей лечебной тактикой, применяемой согласно классификации ХТ по Б. С. Преображенскому и В.Т. Пальчуну, наглядно видно, что хирургическое лечение является наиболее обоснованным при ХТ ТАФ II.

Список литературы

1. Пальчун В.Т. Классификация и лечебная тактика при хроническом тонзиллите. Вестник оториноларингологии. 2013;78(3):8-11. Режим доступа: https://www.mediasphera. ru/issues/vestnik-otorinolaringolog ii/2013/3/030042-4668201332.
2. Bhattachatyya N., Kepnes L.J. Economic Benefit of Tonsillectomy in Adults with Chronic Tonsillitis. Annals of Otology, Rhinology & Laryngology. 2002;111(11):983-988. https://doi.org/10.1177/000348940211101106.
3. Пальчун В.Т., Гуров А.В., Гусева О.А. Патогенетические особенности формирования хронической тонзиллярной патологии. Вестник оториноларингологии. 2018;83(2):30-33. https://doi.org/10.17116/otorino201883230-33.
4. Преображенкский Б.С., Попова Г.Н. Ангина, хронический тонзиллит, сопряженные с ними общие заболевания. М.: Медицина; 1970.
5. Lange M.J., Lasiter J.C., Misfeldt M.L. Toll-like receptors in tonsillar epithelial cells. International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology. 2009;73(4):613-621. https://doi.org/10.1016/j.ijporl.2008.12.013.
6. Avramović V., Petrović V., Jović M., Vlahović P. Quantification of cells expressing markers of proliferation and apoptosis in chronic tonsilitis. Acta Otorhinolaryngologica Italica. 2015;35(4):277-84. Available at: https://www. http://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4731890.

Ключевые слова: хронический тонзиллит небные миндалины иммуногистохимия пролиферация апоптоз антиапоптоз Т-лимфоциты B-лимфоциты chronic tonsillitis immunohistochemistry proliferation apoptosis antiapoptosis T-lymphocytes B-lymphocytes

Другие статьи

Некоторые аспекты приверженности к комбинированной гормональной контрацепции у молодых женщин

21. 10.2022

Эффективность пробиотиков в лечении синдрома раздраженного кишечника

20.10.2022

Антикоагулянтная терапия прямыми пероральными антикоагулянтами в условиях полипрагмазии: курс на безопасность

19.10.2022

Инозин пранобекс в лечении цервикальной интраэпителиальной неоплазии легкой степени (опыт клинического применения)

18.10.2022

Эффективность эзофагопротектора в лечении пациентов с гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью: систематический обзор

17. 10.2022

Аномалии зубов: классификация, причины и лечение

14.10.2022

миндалин | Лимфоидная система

Миндалины | Лимфоидная система

Руководство по гистологии

ГЛАВА 10 — ЛИМФОЗНАЯ ТКАНЬ

НАСТРОЙКИ

Режим отображения

Темно-светлый

Параметры просмотра

Миниатюра навигатора Панель инструментов Кнопки увеличения (слева) Размер просмотра (справа) Указатель (кнопки в правом углу панели инструментов) Маленький Средний (по умолчанию) БольшойУказатель цвета Координаты Закладки Маленький Средний (по умолчанию) Большой Цвет по умолчанию
Перемещение между закладками: клавиши Tab/Backspace Кнопки «Предыдущий/следующий» (левый/правый края) Масштабная полоса Цвет текста и линии
Цвет фона
Список представлений

Описание

Просмотреть как несколько страниц (по умолчанию)
Просмотреть как одну страницу

Размер шрифта

Маленький
Средний (по умолчанию)
Большой

HELP

Для получения дополнительной информации см. HELP .

Каждый слайд показывается с дополнительной информацией справа. Изображение можно изменить с помощью любой комбинации следующих команд.

Боковая панель

• Нажмите на ссылки , чтобы перейти к определенному региону.
• Нажмите на изображений , чтобы отобразить это представление.
• Используйте панель инструментов для изменения масштаба и панорамирования отображаемого изображения.

Мышь

• Нажмите, чтобы увеличить
• Дважды щелкните, чтобы уменьшить масштаб
• Alt-щелчок для уменьшения масштаба
• Alt-двойной щелчок для уменьшения масштаба для всего слайда
• Перетащите изображение на панораму

Клавиатура

• Клавиша Shift или «A» для увеличения
• Ctrl или клавиша «Z» для уменьшения масштаба
• Клавиши со стрелками для панорамирования по изображению
• Клавиша ESC для уменьшения масштаба для всего слайда

Сенсорный экран

• Нажмите, чтобы увеличить масштаб
• Двойное нажатие для уменьшения масштаба
• Alt-тап для уменьшения масштаба для всего слайда
• Перетащите изображение на панораму

ПОДЕЛИТЬСЯ

Ссылку на виртуальный слайд можно сохранить для последующего просмотра различными способами.

Буфер обмена

Адрес этого представления скопирован в буфер обмена. Эту ссылку можно вставить в любую другую программу.

Закладка

Ссылку на закладку можно создать с помощью функции закладки ( Ctrl-D для Windows или Cmd-D для Mac) вашего браузера. Выберите имя закладки и выберите папку, в которой вы хотите ее сохранить.

Электронная почта

Это представление может быть отправлено кому угодно.

Dictionary — Normal: Tonsil — The Human Protein Atlas Категория области мозга (РНК)Категория мозга мыши (РНК)Категория мозга свиньи (РНК)Оценка надежности мозга мышиКатегория типа клеток (РНК)Кластер экспрессии одноклеточного типа (РНК)Обогащение типа клеток (РНК)Прогностический ракКатегория рака (РНК)Категория иммунных клеток (РНК)Категория линии иммунных клеток (РНК)Кластер экспрессии иммунных клеток (РНК)Аннотация секретомаСубклеточная локализация (ICC)Субклеточная локализация — клеточная линия (ICC)Пик фазы субклеточного клеточного циклаОценка клеток (ICC)Категория клеточной линии (РНК)Экспрессия клеточной линии Кластер (РНК) Метаболический путьСводка доказательствДоказательства UniProtДоказательстваNeXtProtДоказательства HPAБелковый массив (PA)Вестерн-блоттинг (WB)Иммуногистохимия (IHC)Иммуноцитохимия (ICC)С tibodiesИмеет данные о белкеСортировать по

Gene name

Class
Blood group antigen proteinsCancer-related genesCandidate cardiovascular disease genesCD markersCitric acid cycle related proteinsDisease related genesEnzymesFDA approved drug targetsG-protein coupled receptorsHuman disease related genesImmunoglobulin genesMapped to neXtProtMapped to UniProt SWISS-PROTMetabolic proteinsNuclear receptorsPlasma proteinsPotential drug targetsPredicted intracellular белки Предсказанные мембранные белки Предсказанные секретируемые белки Доказательства белков (Ezkurdia et al 2014) Доказательства белков (Kim et al 2014) Белки, связанные с путем RAS Рибосомные белки Белки, связанные с РНК-полимеразой Гены Т-клеточных рецепторов Факторы транскрипции Транспортеры Потенциальнозависимые ионные каналы

Subclass

Class
Biological processMolecular functionDisease

Keyword

Chromosome
12345678910111213141516171819202122MTUnmappedXY

External id

Tissue
AnyAdipose tissueAdrenal glandAppendixBone marrowBreastBronchusCartilageCaudateCerebellumCerebral cortexCervixChoroid plexusColonDorsal rapheDuodenumEndometriumEpididymisEsophagusEyeFallopian tubeGallbladderHairHeart muscleHippocampusHypothalamusKidneyLactating breastLiverLungLymph nodeNasopharynxOral mucosaOvaryPancreasParathyroid glandPituitary glandPlacentaProstateRectumRetinaSalivary glandSeminal vesicleSkeletal muscleSkinSmall intestineSmooth muscleSoft tissueSole of ступняСелезенкаЖелудокЧерная субстанцияЯичкиВилочковая железаЩитовидная железаМиндалиныМочевой пузырьВлагалище

Cell type

Expression

Patient ID

Tissue
AnyAdipose tissueAdrenal glandBone marrowBrainBreastCervixChoroid plexusEndometriumEpididymisEsophagusFallopian tubeGallbladderHeart muscleIntestineKidneyLiverLungLymphoid tissueOvaryPancreasParathyroid glandPituitary glandPlacentaProstateRetinaSalivary glandSeminal vesicleSkeletal muscleSkinSmooth muscleStomachTestisThyroid glandTongueUrinary bladderVagina

Category
Tissue enrichedGroup enrichedTissue enhancedLow tissue specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleСамая высокая выраженность

Кластер
82: Жировая ткань — Организация внеклеточного матрикса17: Надпочечники — Метаболизм стероидов14: В-клетки — Гуморальный иммунный ответ75: Костный мозг — сплайсинг мРНК и клеточный цикл65: Мозг — Ионный транспорт70: Мозг — Развитие нервной системы10: Мозг — Нейронная сигнализация73 :Мозг — Нейропептидная сигнализация6:Мозг — Восприятие запаха58:Мозг — Синаптическая функция76:Мозг и костный мозг — Организация хроматина32:Мозг и лимфоидная ткань — Неизвестная функция27:Мозг и кожа — Неизвестная функция5:Грудь — Неизвестная функция69:Мозжечок – Регуляция экспрессии генов88:Сосудистое сплетение – Трансмембранный транспорт42:Реснитчатые клетки – Реснички и проекции клеток49:Реснитчатые клетки – Организация ресничек30:Эпидидимис – Антимикробная активность68:Эпидидимис – Неизвестная функция84:Пищевод – Функция эпителиальных клеток89:Фибробласты – Организация внеклеточного матрикса44:Сердце – Сокращение сердечной мышцы 38: Сердце — сокращение мышц 16: Иммунные клетки — Иммунный ответ 45: Кишечник — Щеточная граница 56: Кишечник — Трансмембранный транспорт 37: Кишечник — Неизвестная функция 87: Кишечник и почки — Трансмембранный транспорт 41: Кишечник и печень — Метаболизм липидов 7: Почки — Трансмембранный транспорт 81: Почки & Печень — Метаболизм62:Печень — Гемостаз60:Печень — Гемостаз и метаболизм липидов85:Печень — Метаболизм86:Печень и плацента — Транспорт через ER19: Легкие — функция легких66: лимфоидная ткань — регуляция иммунного ответа 64: макрофаги — иммунный ответ 67: нейтрофилы — гуморальный иммунный ответ 40: нейтрофилы — воспалительный ответ 57: неспецифический — ангиогенез 53: неспецифический — регуляция клеточного цикла 54: неспецифический — организация микротрубочек 39: Неспецифические — Митохондрии55:Неспецифические — Митохондрии и протеасомы52:Неспецифические — Рибосомы72:Неспецифические — Транскрипция59:Неспецифические — Трансляция51:Неспецифические — Неизвестная функция29:Неспецифические — Везикулярный транспорт25:Поджелудочная железа — Пищеварение48: Паращитовидная железа — мембранные белки 26: Гипофиз — Гормональная сигнализация 28: Плацента — Беременность 79:Сетчатка — Фототрансдукция77:Сетчатка — Зрительное восприятие20:Сетчатка и лимфоидные ткани — Неизвестная функция24:Слюнные железы — Слюнная секреция61:Кожа — Ороговение31:Кожа — Развитие эпидермиса12:Гладкая мышечная ткань — Смешанная функция11:Плоскоклеточные эпителиальные клетки — Функция эпителиальных клеток4:Желудок — Пищеварение 33: Поперечно-полосатые мышцы — Сокращение мышц 80: Поперечно-полосатые мышцы — Неизвестная функция 63: Т-клетки — Адаптивный иммунный ответ 23: Яички — Регуляция клеточного цикла 71: Яички — Репарация ДНК 83: Яички — Сперматогенез 43: Яички — Неизвестная функция 1: Щитовидная железа — Транскрипция

Reliability
EnhancedSupportedApprovedUncertain

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMedulla oblongataMidbrainPonsSpinal cordThalamusWhite matter

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMidbrainOlfactory bulbPituitary glandPons and продолговатый мозгСетчаткаТаламусБелое вещество

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMedulla oblongataMidbrainOlfactory bulbPituitary glandPonsRetinaSpinal cordThalamusWhite matter

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleНаиболее выражено

Reliability
SupportedApproved

Cell type
AnyAdipocytesAlveolar cells type 1Alveolar cells type 2AstrocytesB-cellsBasal keratinocytesBasal prostatic cellsBasal respiratory cellsBasal squamous epithelial cellsBipolar cellsBreast glandular cellsBreast myoepithelial cellsCardiomyocytesCholangiocytesClub cellsCollecting duct cellsCone photoreceptor cellsCytotrophoblastsDendritic cellsDistal enterocytesDistal tubular cellsDuctal cellsEarly spermatidsEndometrial ciliated cellsEndometrial stromal cellsEndothelial cellsEnteroendocrine cellsErythroid cellsExcitatory нейроны Экзокринные железистые клетки Экстраворсинчатые трофобласты Фибробласты Желудочные слизесекретирующие клетки Железистые и просветные клетки Гранулоциты Гранулезные клетки Звездчатые клетки печени Гепатоциты Клетки Хофбауэра Горизонтальные клетки Ингибирующие нейроны Бокалокишечные клетки Ионоциты Клетки Купфера Клетки Лангерганса Поздние сперматиды Клетки Лейдига клетки-предшественники ооцитовОлигодендроцитыЭндокринные клетки поджелудочной железы Клетки ПанетаПеритубулярные клеткиПлазматические клеткиКлатки предстательной железыПроксимальные энтероцитыПроксимальные тубулярные клеткиДыхательные реснитчатые клеткиПалочковые фоторецепторные клеткиСертоликлеткиСкелетные миоцитыГладкомышечные клеткиСперматоцитыСперматогонииПлоскоклеточные эпителиальные клеткиСупрабазальные кератиноцитыСинцитиотрофобласты0003

Category
Cell type enrichedGroup enrichedCell type enhancedLow cell type specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Tissue
Adipose subcutaneousAdipose visceralBreastColonHeart muscleKidneyLiverLungPancreasProstateSkeletal muscleSkinStomachTestisThyroid

Cell type

Enrichment
Very highHighModerate

Cancer
Breast cancerCervical ракКолоректальный ракКолоректальный ракРак эндометрияГлиомаРак головы и шеиРак печениРак легкихРак легкихМеланомаРак яичниковРак поджелудочной железыРак предстательной железыРак почкиРак почкиРак почкиРак желудкаРак яичекРак щитовидной железыРак мочевого пузыря

Prognosis
FavorableUnfavorable

Cancer
AnyBreast cancerCervical cancerColorectal cancerEndometrial cancerGliomaHead and neck cancerLiver cancerLung cancerMelanomaOvarian cancerPancreatic cancerProstate cancerRenal cancerStomach cancerTestis cancerThyroid cancerUrothelial cancer

Category
Cancer enrichedGroup enrichedCancer enhancedLow cancer specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Тип клеток
ЛюбыеБазофилыКлассические моноцитыЭозинофилыGdT-клеткиПромежуточные моноцитыMAIT Т-клеткиВ-клетки памяти CD4 Т-клетки памяти CD8 Т-клеткиМиелоидные DCN-наивные В-клеткиНаивные CD4-Т-клеткиНаивные CD8-клеткиНейтрофилы NK-клеткиНеклассические моноцитыПлазмацитоид Категория 5 002 Imm 9000 DCT-regTotal PBMC 9000 Обогащено клеткамиГрупповое обогащениеУсиление иммунных клетокНизкая специфичность иммунных клетокНе обнаружено в иммунных клеткахНе обнаруженоОбнаружено во всехОбнаружено во многихОбнаружено в некоторыхОбнаружено в единичныхИмеет наивысшую экспрессию

Линия клеток
Любые В-клетки Дендритные клетки Гранулоциты Моноциты NK-клетки Т-клетки иммунный ответ43:В-клетки — гуморальный иммунный ответ37:В-клетки — транскрипция24:В-клетки — неизвестная функция41:базофилы — клеточное дыхание46:базофилы — связывание ДНК38:базофилы — неизвестная функция18:базофилы — везикулярный транспорт45:эозинофилы — врожденный иммунный ответ52: Эозинофилы — Транскрипция49:Эозинофилы — неизвестная функция36:GdT-клетки — адаптивный иммунный ответ5:гранулоциты — неизвестная функция16:MAIT-клетки — неизвестная функция25:моноциты — воспалительный ответ51:моноциты — врожденный иммунный ответ14:моноциты — неизвестная функция28:миелоидные ДК — неизвестная функция50:нейтрофилы — Клеточное старение 33: Нейтрофилы — Организация хроматина 8: Нейтрофилы — Воспалительный ответ 9: Нейтрофилы — Врожденный иммунный ответ 1: Нейтрофилы — Смешанная функция 15: NK-клетки — Транскрипция 48: NK-клетки — Неизвестная функция 12: Неспецифические — Основные клеточные процессы 27: Неспецифические — Ген выражение31: неспецифический — воспалительный ответ26: неспецифический — митохондрии39:Неспецифический — процессинг мРНК44:Неспецифический — Транскрипция30:Неспецифический — Трансляция47:Плазмоцитоидные ДК — Сворачивание белка29:Плазмоцитоидные ДК — Неизвестная функция20:Т-клетки — Т-клеточный рецептор32:Т-клетки — Неизвестная функция4:Т- regs — Регуляция клеточного цикла35:T-regs — Функция неизвестна

Аннотация
Гены иммуноглобулинов Внутриклеточные и мембранныеСекретируются — локализация неизвестнаСекретируется в головном мозгеСекретируется в женской репродуктивной системеСекретируется в мужской репродуктивной системеСекретируется в других тканяхСекретируется в кровьСекретируется в пищеварительную системуСекретируется во внеклеточный матрикс

Location
Actin filamentsAggresomeCell JunctionsCentriolar satelliteCentrosomeCleavage furrowCytokinetic bridgeCytoplasmic bodiesCytosolEndoplasmic reticulumEndosomesFocal adhesion sitesGolgi apparatusIntermediate filamentsKinetochoreLipid dropletsLysosomesMicrotubule endsMicrotubulesMidbodyMidbody ringMitochondriaMitotic chromosomeMitotic spindleNuclear bodiesNuclear membraneNuclear specklesNucleoliNucleoli fibrillar centerNucleoli rimNucleoplasmPeroxisomesPlasma membraneRods & RingsVesicles

Searches
EnhancedSupportedApprovedUncertainIntensity variationSpatial variationCCD protein mitotic structureCCD protein interphaseCell cycle dependent proteinCell cycle independent proteinCell cycle dependent transcriptCell cycle independent transcriptMultilocalizingLocalizing 1Localizing 2Localizing 3Localizing 4Localizing 5Localizing 6Main locationAdditional location

Location
AnyActin filamentsAggresomeCell JunctionsCentriolar satelliteCentrosomeCleavage furrowCytokinetic bridgeCytoplasmic bodiesCytosolEndoplasmic reticulumEndosomesFocal adhesion sitesGolgi apparatusIntermediate filamentsKinetochoreLipid dropletsLysosomesMicrotubule endsMicrotubulesMidbodyMidbody кольцоМитохондрииМитотическая хромосомаМитотическое веретеноЯдерные тельцаЯдерная мембранаЯдерные спеклыЯдрышкиЯдрышковый фибриллярный центрОбод ядрышкаНуклеоплазмаПероксисомыПлазматическая мембранаПалочки и кольцаВезикулы

Cell line
AnyA-431A549AF22ASC TERT1BJCACO-2EFO-21FHDF/TERT166GAMGHaCaTHAP1HBEC3-KTHBF TERT88HDLM-2HEK 293HELHeLaHep G2HTCEpiHTEC/SVTERT24-BHTERT-HME1HTERT-RPE1HUVEC TERT2JURKATK-562LHCN-M2MCF7NB-4OE19PC-3REHRH-30RPTEC TERT1RT4SH-SY5YSiHaSK-MEL-30SuSaTHP-1U -2 OSU-251 мг

Тип
Белка

Фаза
G1SG2

Достоверность
EnhancedSupportedEprodUncure

Cell Line
Anya-431A549AF2AN3-CAASC DIFFASC TERT1BEBJBJBJ-HER-HERT+ BJBJ-HERS+ BJBJ-HERS+ BJBJ-HERS+ BJBJ-HERTS+ BJBJ-HERTS+ BJBJBJASPASC TERT1BJ-431AF2 2DaudiEFO-21FHDF/TERT166GAMGHaCaTHAP1HBEC3-KTHBF TERT88HDLM-2HEK 293HELHeLaHep G2HHSteCHL-60HMC-1HSkMCHTCEpiHTEC/SVTERT24-BHTERT-HME1HTERT-RPE1HUVEC TERT2JURKATK-562Karpas-707LHCN-M2MCF7MOLT-4NB-4NTERA-2OE19PC-3REHRH-30RPMI-8226RPTEC TERT1RT4SCLC-21HSH-SY5YSiHaSK-BR-3SK-MEL-30SuSaT-47dTHP-1TIMEU -138 МГУ-2 ОСУ-2197У-251 МГУ-266/70У-266/84У-698У-87 МГУ-937WM-115

Категория
Клеточная линия обогащеннаяГрупповая обогащеннаяКлеточная линия усиленнаяНизкая специфичность клеточной линииНе обнаруженоОбнаружено у всехОбнаружено у многихОбнаружено у некоторыхОбнаружено у единичныхIs максимально выраженный

Кластер
23:AN3-CA — Регуляция транскрипции28:BEWO — Регуляция транскрипции10:BJ & FHDF — Организация ECM39:CACO-2 — Неизвестная функция38:EFO-21 — Неизвестная функция42:Линии эпителиальных клеток — Функция эпителиальных клеток30:Линии эпителиальных клеток — Трансляция44:HDLM-2 — Иммунный ответ19:HEK293 и PC-3 — Регуляция транскрипции36:HEL — Гемостаз20:HeLa — Митохондрии37:Hep G2 — Отростки клеток гепатоцитов3:HMC-1 — Врожденный иммунный ответ22:JURKAT & MOLT-4 — Адаптивный иммунный ответ1 :K-562 — Эритропоэз2:Карпас-707 — Иммунный ответ4:Мезенхимальные клеточные линии — Противовирусный иммунный ответ34:Мезенхимальные клеточные линии — Организация ВКМ24:NB-4 — Иммунный ответ12:НЭС — Развитие нервной системы40:Неспецифический — Основные клеточные процессы26: Неспецифический — Регуляция клеточного цикла5:NTERA-2 — Транскрипция21:OE19- Митохондрии14:REH — Неизвестная функция31:RH-30 и LHCN-M2 — Сокращение мышц11:RPE1 и U-87MG — Синаптическая функция25:RPMI-8226 — Иммунный ответ35:RPTEC-TERT1 — Процессы в почках15:RT4 — Неизвестная функция7:SCLC-21H — Нейрональная сигнализация13:SH-SY5Y — Развитие нервной системы8:SK-BR-3 — Неизвестная функция33:SK-MEL-30 — Меланоцитарные процессы6:T47d — Молочная железа43:THP-1 — Врожденный иммунный ответ41:TIME & HUVEC/TERT2 — Эндотелиальный функция ячейки9: ОС U-2 — неизвестная функция18:U-2197 — организация ECM29:U-266 — Адаптивный иммунный ответ16:U-266 — Нуклеосома27:U-698-M & Daudi — Адаптивный иммунный ответ32:U-937 — Врожденный иммунный ответ17:WM-115 — Развитие нервной системы

Путь
Гидролиз ацил-КоА Ацилглицериды метаболизмАланин; Метаболизм аспартата и глутамата Метаболизм аминосахара и нуклеотидного сахара Биосинтез аминоацил-тРНК Метаболизм андрогенов Метаболизм арахидоновой кислоты Метаболизм аргинина и пролина Метаболизм аскорбата и альдарата Бета-окисление жирных кислот с разветвленной цепью (митохондриальное) Бета-окисление ди-ненасыщенных жирных кислот (n-6) (митохондриальное) Бета-окисление диненасыщенные жирные кислоты (n-6) (пероксисомальные)Бета-окисление жирных кислот с четной цепью (митохондриальное)Бета-окисление жирных кислот с четной цепью (пероксисомальное)Бета-окисление жирных кислот с нечетной цепью (митохондриальное)Бета-окисление фитановых кислотное (пероксисомальное)Бета-окисление полиненасыщенных жирных кислот (митохондриальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-7) (митохондриальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-7) (пероксисомальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот ( п-9) (митохондриальный) Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-9) (пероксисомальный) Метаболизм бета-аланина Биосинтез желчных кислот Рециркуляция желчных кислот Метаболизм биоптерина Метаболизм биотина Биосинтез группы крови Метаболизм бутаноатов Метаболизм двухосновных кислот с разветвленной цепью C5 )Карнитиновый челнок (пероксисомальный)Биосинтез холестерина 1 (путь Блоха)Биосинтез холестерина 2Биосинтез холестерина 3 (путь Кандуща-Рассела)Метаболизм холестеринаБиосинтез хондроитина/гепарансульфатаХондроитинсульфатная деградацияКоАсинтезЦистеин и метионинметаболизмЛекарственный метаболизмЭйкозаноидный метаболизмЭстрогенный метаболизмЭфирный липидный обменАктивация жирных кислот (цитозольная)Активация жирных кислот ( эндоплазматический ретикулярный)Биосинтез жирных кислотБиосинтез жирных кислот (четная цепь)Биосинтез жирной кислоты (нечетная цепь)Биосинтез жирной кислоты (ненасыщенный)Десатурация жирной кислоты (четная цепь)Десатурация жирной кислоты n (нечетная цепь) Удлинение жирных кислот (четная цепь) Удлинение жирных кислот (нечетная цепь) Окисление жирных кислот Метаболизм фолиевой кислоты Образование и гидролиз эфиров холестерина Метаболизм фруктозы и маннозы Метаболизм галактозы Биосинтез глюкокортикоидов Метаболизм глутатиона Метаболизм глицеролипидов Метаболизм глицерофосфолипидов Глицин; serine and threonine metabolismGlycolysis / GluconeogenesisGlycosphingolipid biosynthesis-ganglio seriesGlycosphingolipid biosynthesis-globo seriesGlycosphingolipid biosynthesis-lacto and neolacto seriesGlycosphingolipid metabolismGlycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesisHeme degradationHeme synthesisHeparan sulfate degradationHistidine metabolismInositol phosphate metabolismIsolatedKeratan sulfate biosynthesisKeratan sulfate degradationLeukotriene metabolismLinoleate metabolismLipoic acid metabolismLysine metabolismMetabolism of other amino acidsMiscellaneousN-glycan metabolismNicotinate и метаболизм никотинамида Метаболизм нуклеотидов Метаболизм О-гликанов Метаболизм омега-3 жирных кислот Метаболизм омега-6 жирных кислот Окислительное фосфорилирование Биосинтез пантотената и КоА Пентозо- и глюкуронатные взаимопревращения Пентозофосфатный путь Метаболизм фенилаланина Фенилаланин; tyrosine and tryptophan biosynthesisPhosphatidylinositol phosphate metabolismPool reactionsPorphyrin metabolismPropanoate metabolismProstaglandin biosynthesisProtein assemblyProtein degradationProtein modificationPurine metabolismPyrimidine metabolismPyruvate metabolismRetinol metabolismRiboflavin metabolismROS detoxificationSerotonin and melatonin biosynthesisSphingolipid metabolismStarch and sucrose metabolismSteroid metabolismSulfur metabolismTerpenoid backbone biosynthesisThiamine metabolismTransport reactionsTricarboxylic acid cycle and glyoxylate/dicarboxylate metabolismTryptophan metabolismTyrosine metabolismUbiquinone synthesisUrea cycleValine; лейцин; и изолейцина Метаболизм витамина А Метаболизм витамина В12 Метаболизм витамина В2 Метаболизм витамина В6 Метаболизм витамина С Метаболизм витамина D Метаболизм витамина Е Метаболизм ксенобиотиков

Категория
Доказательства на уровне белка Доказательства на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта

Балл
Доказательства на уровне белка Доказательства на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта Оценка
Доказательство на уровне белка Доказательство на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта

Валидация
Поддержано Утверждено Неопределенно

Validation
Enhanced — CaptureEnhanced — GeneticEnhanced — IndependentEnhanced — OrthogonalEnhanced — RecombinantSupportedApprovedUncertain

Validation
Enhanced — IndependentEnhanced — OrthogonalSupportedApprovedUncertain

Validation
Enhanced — GeneticEnhanced — IndependentEnhanced — RecombinantSupportedApprovedUncertain

Antibodies
YesNo

In atlas
TissueCellPathologyBrainBlood — conc.